玩家在《热血海贼王》中，只要达到了一定的级别，就可以进入到系统自动开启的“出航”中。玩家需要点击游戏主界面中的“出航”选项，也可以点击“主船”，在这个界面中，找到“船长室”并点击，打开“船长室”的主界面就可以选择出航了。
出航对于玩家来说，第一次在游戏中可以获得的出航次数是30次，在这之后每天获得10次出航的机会。玩家应该根据自己所做的每日任务，来合理安排出航。
在出航时，玩家如果猛点“出航”还会在奇遇一栏中，遇一些奇遇。在进行答题时，如果实在无法马上选出答案来，可以考虑到网上的一些游戏论坛中看看出航答案。回答正确之后，就可以获得声望与金币。
除了每天的出航，玩家如果想获得额外出航，可以点击“金币出航”的图标。玩家可以选择每天用5次金币来出航。第一次出航使用1个金币，到了第五次才可以使用5个金币。
船舱贸易室得到升级之后，玩家出航还可以随机获得10的金币奖励。